O jogador vive Jackie Estacado, que agora é o chefe da família criminosa Franchetti, e é portador de uma força antiga e cruel conhecida como The Darkness, que traz o caos e a destruição.

Esta edição se destaca visualmente com seu estilo gráfico noir, e por ser o único jogo de ação em primeira pessoa a apresentar quad-wielding: a capacidade de utilizar simultaneamente quatro armas diferentes. Faz dois anos que Jackie usou pela última vez seu poder, matando os responsáveis pelo assassinato da namorada.

Ele não consegue superar a lembrança da morte de Jenny desde que aprisionou The Darkness, e agora esta força quer se libertar. Quando ele sofre um atentado mal sucedido, abre-se a porta para o ressurgimento de The Darkness, o que coloca Jackie numa missão brutal e pessoal, à medida que ele precisa desvendar o mistério por trás do ataque e das motivações de The Darkness.